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南京格致基因生物科技有限公司

行业领域:生物医药
行政区域:南京市
参赛届数:第五届
获得奖项:二等奖
企业简介:

    南京格致基因生物有限公司成立于 2016年,旗下有格致医学、格致大健康、格致大数据三个子公司。格致基因专注于面向大众的癌症早期筛查及复发监控服务,以技术创新推动癌症的“早发现、早诊断、早治疗”,让癌症在中国成为可预防、可控制、可治愈的疾病,为大众、医疗机构及社会保障系统创造价值。以循环肿瘤DNA血液检测这一革命性技术为基础,结合自主开发的数字DNA降噪算法及染色体结构性变化分析算法,及硬件加速计算分析平台,能够更准确、快速、经济地对数据进行解读,将癌症的早期监控预防、临床辅助诊断,及术后复发监控等重要环节进行有机衔接,为用户建立完整的肿瘤防治方案。 格致医学汇集国际一流的相关行业人才,生物信息学团队包括来自英国阿斯利康和美国强生的生物信息负责人,以及罗氏诊断测序部门主任研究员。团队掌握最新的血液循环肿瘤DNA(ctDNA)检测与基因信息分析技术,拥有诸多科研及临床项目经验,已申请多项国内外专利,并与国际领先技术保持持续交流。 格致大数据专注于基因大数据处理技术研发和解决方案,致力于为精准医学领域的用户提供更便利、高效的计算设备和服务。格致大数据最新发布的Xiphias高性能生物信息计算平台搭载了自主研发的基因数据处理芯片,利用高度优化的生物信息处理软件,结合硬件的专用计算优势,对整个基因数据处理流程进行了优化及加速。


项目简介:

    本项目将研发优化基因数据处理专用芯片,并基于此,构造基因数据处理一体机及集群。基因数据处理芯片如图1所示,基因数据处理专用芯片基于FPGA(现场可编程逻辑门阵列),其将基因数据分析的复杂、规模化计算以硬件芯片的形式实现,这些计算包括GZIP压缩,动态规划等,芯片的实现将使这些计算的速度得到30倍以上的提升。基于基因数据处理芯片的一体机如图2所示,该一体机的系统设计是将基因数据处理专用芯片通过PCI-E接口插入到现在的服务器或个人电脑中,构成一台基因数据计算、压缩、存储的专用设备。使用该平台,基因数据的处理效率达到30倍以上的提升,存储效率得到成倍提升。由此将构建基因数据高性能计算及存储平台,使得基因数据处理速度和效率得到30倍以上的提升,存储效率提高2倍以上。处理效率和存储效率的提升,将大幅提升用户数据计算和存储效率,降低成本。